九岁的地球孩子「满满」，一天晚上在自己的衣柜里发现了来自多萌星系的外星小红人「萌奇」，得知宇宙飞船损毁严重，需要很长时间进行修复，充满正义感以及好奇心的满满于是决定将萌奇留在家中。为了表示感谢，萌奇决定用自己发明的「魔法心愿机」来帮助满满实现各种愿望，但是......由于魔法心愿机的不稳定性和满满自身的小缺点，实现的愿望往往事与愿违，笑料不断。
《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
