万族时代，为争夺更多资源，不同种族之间互相争斗，甚至不惜掀起大战。在血雨腥风和尔虞我诈的时代里，随着古人族消失在历史长河中，新的人族踏着鲜血崛起，为了生存而战......
继《迪迦奥特曼剧场版:最终圣战》的故事时间之后火星移民计划启动，人类纷纷登陆火星和其他领域。新的GUTS——SUPER GUTS成立了，并替代了原GUTS。 转眼间7年过去了，人类取得了巨大的突破，开始了对多种未知世界的开拓。地球人怀着单纯的憧憬以及无限的探求心，向太空进发，人们将此称为新领域的时代。但与此同时，一些新的可怕力量也都苏醒过来。 本作的主人公飞鸟信，是在光中消失的宇航飞行员飞鸟一马的儿子。当时的飞鸟信还和他的父亲约定回来看他打棒球，在此时他却从戴民长官那里得知了噩耗。
在一片终日不见光明的大陆“琥珀之地”上，有一个神圣的职业——信蜂。在这片人工太阳照耀不到、蔓延着黑暗的危险之地，信蜂赌上性命也要为国民递送重要的“信件”。高修（福山润 配音）就是一名优秀的信蜂，这天他要送递的“信件”是一名叫拉格（泽城美雪 配音）的少年。拉格的母亲于某日被一群陌生人强行带走，拉格的母亲将他作为信件，送往外海小镇的婶婶家。运送途中，拉格为高修那颗坚强而温柔的心所吸引。因为崇敬高修，拉格决心要成为一名优秀的信蜂。12岁时他通过考试成为信蜂，却意外发现高修已经不再是信蜂，而且失去了“心”，下落不明。拉格踏上信蜂之路，递送着人们“心”和“希望”的信件，他要找到高修……
