时间是1968年，当学生运动愈演愈烈之际，某大学的医学部出现了一个奇怪的男子。他有着黑白相间的头发，全身到处都是伤痕，而带着伤疤的脸也成为注册商标。这个男人为了获得医师资格证而学习，他的名字是间黑男，并且他通过自己天才的能力，创造了无数的奇迹。并且被后人称为黑杰克。
玄都山掌教沈峤一心避世，却无意中卷入江湖纷争，身中奇毒，坠下山崖双目失明，被浣月宗主晏无师救起后，随晏无师游历江湖，逐渐找回失去的记忆，揭开了隐藏在纷繁芜杂事件中的大阴谋。一本武林秘籍的出现搅乱了武林平和的假象，看主人公是否能看破全局修得剑心。
由于风之神希尔的失误而死亡，转生了的青年巧。
