《神奇宠物：城市》介绍了三位英雄：豚鼠伊兹、蛇泰特和兔子祖瑞。这些英勇的课堂宠物住在纽约市的一所幼儿园，他们驾驶神奇的“喷气车”环游世界，在音乐剧和迷你歌剧主题的冒险中拯救动物。当事情变得艰难时，伊兹、泰特和祖瑞总是记得结合他们的才能和能力，共同努力挽救局面——因为只要他们齐心协力，没有什么是他们做不到的。
美乐蒂在玛莉田园开了一间蛋糕店，但自从她在森林里碰见一颗心脏后，周遭就开始接连发生怪事。与此同时，酷洛米开在对面的和菓子店总是生意惨淡，于是她决心弄清楚美乐蒂的蛋糕有什么秘密。美乐蒂和库洛米为了甜点大赛努力准备，要在国际级甜点名厨皮斯塔齐奥面前拿出好表现。不过，没人料得到这场比赛竟会牵扯出攸关玛莉田园命运的大事件。
作品主要讲述了某天，一款掀起大热潮的VRMMORPG「YGGDRASIL」原本会停止一切服务，但即使过了结束时间，玩家也不会退出游戏，NPC也有了各自的思想。现实世界中喜爱电玩的主人公铃木悟（真名）在等待系统强制登出时，与“安兹·乌尔·恭”公会的成员意外穿越到了异世界，并且自己还变成了拥有骷髅外表的最强魔法师——“飞鼠”。就这样，真正的奇幻传说正式拉开帷幕。
艾拉小镇是一个人与精灵共存的时尚小镇，可可和她的小伙伴们生活在这里，她在这里经营着一家名为LALALACOCO的时尚商店。偶然一天，刚搬来艾拉小镇的小女孩露莉，经过可可的商店，被里面漂亮的服饰吸引进去，原本不善打扮，性格害羞的露莉逐渐认识了可可和可可身边的朋友们，在他们的指点和交流下，原本封闭的心也逐渐敞开，变得越来越有自信。
