故事以江户时代后期为舞台,最强死刑犯忍者「画眉丸」为了能再次与最爱的妻子见面,与处刑人「山田浅右卫门佐切」一同前往被称为极乐净土的小岛,找寻「不老不死的仙药」以换取无罪释放,并在岛上与神秘的怪物以及其他死刑犯互相残杀。
天才脑科学家白月魁为救恩师霍恩进行了脑移植术,却不想霍恩受到西弗残存意识的影响......琼斯盗取了天使再生剂注射到19号实验体上引起了一系列异变。同一时间,久川市因为瘟疫感染变成了一片人间炼狱,市长白靖宇和人工智能ASH为了抵御联盟的入侵誓死不降,却不想等到一切尘埃落定之时,真正的末日却来临了