本片是以神木高中“古典部”为舞台，围绕四个部员折木奉太郎、千反田爱瑠、福部里志、伊原摩耶花展开的校园推理剧。神木高中一年级生折木奉太郎是一个“节能”主义者，他信奉“不必要的事不做，非做不可的事就尽快解决”，过着“灰色”的高中生活。不参加任何社团的他，却因为姐姐的拜托而加入了濒临废部的“古典部”。在古典部他结识了好奇心旺盛的千金小姐千反田爱瑠，国中好友福部里志、伊原摩耶花也相继加入古典部。
在寻找返回地球的途中，绿巨人发现了潜藏在飞船上的领袖。S.M.A.S.H.特工必须与控诉者罗南及其克里士兵展开战斗，以拯救宿敌：生命星球伊戈。然而，当行星吞噬者前来吞噬生命星球伊戈时，S.M.A.S.H.特工必须冒着生命危险，拯救两位敌人的生命。
