讲述了蚩尤身为实力强大的兵主，肉身虽死但其神魂不散，传说千万年轮回后，人族中将有一人继承蚩尤兵主之魂一统山海界，打破黄帝设下的桎梏重返炎黄大陆。随着临海城一位名叫黎石的少年长大，兵主之魂显现，巫族和妖族暗流涌动，为称霸山海界正酝酿一场巨大的人间浩劫的故事。
故事延续第二季主线，灵界与斗魂卫在利益纠葛之下冲突不断，本季灵界派出强盛军队欲对斗魂卫赶尽杀绝，两方势力都在以正在举办门宗大会的五法山为中心汇集，在这里发生着惨烈的战斗与冲突。
