卡特公司利用人工降雨散播致命病毒，世界沦为末日废墟。少数拥有病毒抗体的人类，成为卡特武装部队的猎杀对象。失忆少年林野在废墟中醒来，意外免疫病毒，踏上逃亡与觉醒之路。他结识同伴、组建抗体者联盟，从逃亡者蜕变为人类希望，最终摧毁卡特阴谋，终结灾难，拯救世界。
主人公小俊意外认识了来自马奇纳星球的警车机器人——炫蓝闪电，并得知地球上现在潜伏着很多来自马奇纳星球的炫卡斗士。为了地球的和平，勇敢的小俊和炫蓝闪电一起踏上了封装炫卡斗士的冒险旅途，寻求人类和炫卡斗士和谐共存的方式。小俊因此结识了各式各样的炫卡斗士，开展惊险刺激的冒险故事……
作品的舞台是战乱不绝的“肯修姆”大陆，其中拥有青之瞳的王国“瑟古亚”与拥有赤之瞳的帝国“尼特鲁多”围绕着大陆的占有率而不停开战，一直处于劣势的青之瞳的王国“瑟古亚”，因音速少年基亚的登场，改变了一直以来处于劣势的战况，故事便由此展开了。
