皇太子在一次民间出巡，邂逅了一位民间女子。这位女子为皇太子诞下一名女儿。适逢盗贼作乱，皇太子与母女俩失散。数年后，皇太子已登基成为皇上，并寻回失散的女儿──甜丝丝。丝丝在民间流落多年，沾染了民间的市井习气，加上生性懒散，皇上为之头疼。皇上为了让丝丝成为一个高贵的格格，于是把她送进尚书房学习。甜丝丝格 格那顽皮、爱捣蛋的可爱性格为皇宫带来了新冲击，故事亦由此而起。此后，甜丝丝认识了尚书房班长心柔柔、从西洋归来的华伦，以及后备武状元白米饭。这四位好友与讨厌小朋友的大臣王坤，在皇宫发生连串趣事。
所谓的“除妖”，即是把由于某些缘由而从原本应在的“隐世”来到“现世”停留的妖怪们送回“隐世”这一工作。某天，被妖怪附体的高中生·芦屋花绘，依靠偶然发现的联络方式，来到了专门除妖的物怪庵，在那里的是一脸不高兴的店主安倍晴斋。由于某些缘故，芦屋就这样以物怪庵奉公人的身份开始工作……安倍与芦屋的除妖组合和妖怪们的物语就此开幕。
