八百年前，明帝之子张若尘，被未婚妻池瑶公主杀死，一代天骄就此陨落。 八百年后，张若尘重新活了过来，却发现曾经杀死他的未婚妻， 已经统一昆仑界，开辟第一中央帝国，号称“池瑶女皇”。 张若尘望着池瑶女皇的神像，心中燃烧起熊熊的仇恨烈焰。 “待我重修十三年，敢叫女皇下黄泉”。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
巨兽时代来啦！这一季里，小咖率领咖宝勇闯恐龙时代破解时空错乱之谜，携手原始人拯救化石危机，雪山勇斗捣蛋小队守卫超级能源，带领动物大迁徙逃离生存危机，勇战狡猾的外星人保护地球和家人
