栗原海里（和气杏未 配音）是一位非常善良的高中生，因为在所有方面都比别人强一点点，所以海里的高中生活过得并不是那么的顺利，周围的人总是和她保持着距离，这让海里倍感孤独。一场意外中，海里遭遇了事故，转生来到了异世界中，她向神明许愿，希望在这里自己能够成为一个所有数值都是平均值的普通少女。
宇宙世纪0153年，这个时候地球联邦已经名存实亡，统治衰颓腐朽，宇宙殖民地纷纷脱离控制，地球圈成为诸多军阀逐鹿的场所；建立于Side 2的新兴国家赞斯卡尔帝国开始对地球的侵略，联邦军根本无法阻挡，只有民间军事组织“神圣军事同盟”还在坚持抵抗。出于一个完全偶然的机会，少年胡索·艾文成为神圣军事同盟的驾驶员，被赋予了最新锐的机体，V高达……
《晶码战士》是一部大型科幻动画片连续剧，以“环保”为主题，围绕“历险”、“励志”展开，讲述了四位主人公与他们的晶码兽为了保护地球，与外星球邪恶集团作斗争的故事。
