你是否想过，在霓虹璀璨的都市之下，潜藏着来自古老神话的怪物？你是否想过，在那高悬于世人头顶的月亮之上，伫立着守望人间的神明？你是否想过，在人潮汹涌的现代城市之中，存在代替神明行走人间的超凡之人？人类统治的社会中，潜伏着无数诡异；在那些无人问津的生命禁区，居住着古老的神明。炽天使米迦勒，冥王哈迪斯，海神波塞冬……而属于大夏的神明，究竟去了何处？在这属于“人”的世界，“神秘”需要被肃清！
某个黄昏时分，我遇见了专门恐吓人类的幽灵妖怪集团“怪奇组”的组长メチャ子。明明我比普通人还要怕鬼六倍，却莫名其妙地卷入了帮怪奇组东山再起的麻烦事里……在我身边，接连不断地发生着似可怕又不可怕的怪奇事件！搞笑恐怖，搞笑恐怖。前所未见的怪诞搞笑剧，此刻开演！
退伍军人刘义遭遇空难，流落荒岛，为生计杀野猪、斗野人。谁知漂亮空姐姐妹花、性感的混血美女、温柔的幼儿园教师纷纷投怀送抱，刘义表示真的一心想要过好日子！谁知意外接受神王传承，未来何去何从？
经过一番艰苦鏖战，救世主战部渡（瓦塔诺）终于和伙伴们打败了多古达及其暗黑军团，创界山（左开山）再次回复原本的秀美景色。在此之后，渡回到人类世界，和朋友们过着快乐的生活。然而好景不长，多古达的弟弟多坏达入侵与创界山息息相关的南斗七星星界山，七色彩虹失去色彩，黑暗重新笼罩大地。在这危急时刻，创界山的人民重新找回渡，请求他打败多坏达军团。渡从圣龙殿女王那里得到许多有用的道具，随后和龙神丸、忍部火美子（希米格）飞往星界山，与先行前往的剑部施巴拉古大师和古拿玛会合。激烈的正邪大战再一次拉开序幕……本片为《魔神英雄传》系列第二部。
