日本东北地区的某座深山里，国中生小町在一间祭拜熊的神社中，担任巫女的重责大任。有一天，小町对监护人，也就是名为那津的熊说：“我想去念都市的高中。”为了能够让不经世事的小町，拥有在都市中生活的基本能力，那津展开了一连串的试炼，要求小町通过考验。
明明只差一步便能破入仙门，得道成仙的主角，竟被天劫罚下，重返过去？！也好，往日那些屈辱，就在今日一一报了吧！曾被当作弃棋的主角，误打误撞下居然夺得万族最强功法？！看少年如何成为最强仙帝！
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
