这是五十年后的未来，世界被“神”吞噬殆尽而荒芜的架空故事。 由于遭到突如其来的怪物“荒神”的破坏而失去平衡。在人类文明既有的兵器都因荒神的“捕食”本能而无效化下，生化科技企业“芬里尔”成功利用荒神细胞开发出了名为“神机”的生物兵器。并同时组织了特殊部队“GOD EATER”。自此，人类终于获得了与荒神对抗的力量。
这是有听觉障碍的女大学生·糸濑雪和以雪之大学的前辈在世界旅行的背包客·波岐逸臣的爱情故事。有一天，在逸臣的帮助下，雪开始了两人的交流，雪被自然接触的逸臣所吸引。
