故事的序曲从国中一年级开始。长相乖巧可爱的少女吉冈双叶（内田真礼 配音）不擅长应付男生，总觉得男生很讨厌，唯独隔壁班的田中，在她眼中是一个特别的存在。然而，和田中的青涩恋情还没开始，就随着他的转校而凋谢。转眼间，双叶已经是高一学生。因为国中时曾经被班上的女生排挤，她决定伪装自己原本的样子。 在一个平常的课间，她意外遇见一个长得很像田中的男生，他的身高和声音都跟国中时相差很大，这个叫马渕洸（梶裕贵 配音）的男生究竟是不是当年那个腼腆秀气的田中？砰然心跳，稚嫩青涩的闪烁青春，已经拉开帷幕。
地脉方兴，天荒欲破。天荒世界，人族只是无比弱小的族种，面临严峻的生存危险，又是其他种族的血食。人族四大守护年事已高，还没能找到合适的接班人，最后四人决定，将自身的血肉融入天荒大地，凭天地意志选择新的接班人。数年之后，姬水村的第一天才——姬小发为神秘女子禹雪所骗，失去了自身的命轮，从而沦落为废人，彻底自暴自弃。这一天，护神山的人来到了姬水村，他们接走了资质出众的孩童，以作为下一任的护神山接班人。姬小发命轮破碎，无法一同前往，便只好前往狐爷家，进行修炼。另外一边，荒蛮野兽正在肆意入侵人族部落，一个接着一个的强大反派正慢慢得袭入人族部落，姬小发所面临的彼岸，又将会是什么？
2015年，配以电脑为导航系统的赛车比赛-Cyber Formula，取代了F1（一级方程式）成为21世纪世界最高水平的赛车赛事。14岁的少年风见隼人在护送父亲生前设计的赛车“阿斯拉”（ASURADA）到日本富士冈赛车场途中受到不知名的攻击，危急之下被迫驾驶“阿斯拉”，却因此被系统记录为唯一赛车手，不得不与职业赛车手新条直辉、布里德•加贺、卡尔•里婿特•冯•兰德尔等人一起角逐新世纪的赛车冠军。一站站的赛车比赛，不仅有赛车手之间的竞争，更有与青梅竹马菅生明日香之间的羁绊，风见隼人从此展开了新世纪GPX史上最年轻的冠军传说。
