《大漠枪神》是燕双鹰系列剧第一部《英雄》的翻拍，讲述了身负血仇的青年燕双鹰孤身向盘踞在大漠的日伪余孽、土匪恶霸等恶势力挑战，身经百战，历尽凶险，终于成为大漠一号传奇英雄的故事。面对亲人朋友和无辜百姓一个个死去，燕双鹰毅然与解放军合作，最终走上革命道路，成为了真正的英雄。
惨烈的八年抗战结束，随之而来的是国共两党阋墙之争。国民党逃亡台湾岛，也让许多戎马在外的游子远离了家乡和父母，遥望故乡，惟有泪千行。路根生（张国立 饰）便是这百万退到海岛的老兵中的一员，他们匆匆离开，没有等到“反攻大陆”的时刻，反而在陌生的土地被迫扎根。许多年来根生在江西的结发妻茶嫂（奚美娟 饰）都不知丈夫的死活，他有心回家，但高压的政治环境让他和伙伴们动弹不得。曾经血气方刚的老兵陆长功（陈宝国 饰）如今是警总官员，却反过来监视老兵的一举一动，防止他们有任何企图叛逃匪区的僭越之举。所谓的“荣民”，没有一丝光荣可言，心中的酸楚只有自家清楚。娘盼儿归，浅浅的海峡怎么就阻隔了数十年的回家之路啊……
史达车祸之后对熟悉的环境感到不适应，回快递站上班也是各种被投诉，忍不住联系女朋友夏梦瑶，去夏梦瑶公司示爱，夏梦瑶告诉史达他们已分手。史达被人围堵，被迫动手收拾夏大伟几人。史达顺着少许线索调查，知道自己车祸当天有工业园发生爆炸，他来到工业园寻找线索却遇袭。夏大伟强行让史达签下欠条，夏梦瑶撞到史达被夏大伟绑架，将史达带走。史达再次求复合被拒，心灰意冷之际易枝花打电话怒骂史达，史达只得赶紧去送货。
少女罗疏家道中落落入贱籍，因洞悉人心、善解人意，得花名 “锦囊” 。为改变命运，她毛遂自荐助力新任县令韩慕之破解一起大案，自此暂留县衙化身捕快协助查案，过程中结识了想游历江湖的少年公子齐梦麟。罗疏善破奇情诡案，惨绝人寰的“无头女尸案”、猎奇吊诡的“汾河裸尸案”、人心叵测的“酒坊杀人案”……十大民间奇案接连上演，每看到案中的可怜女子，罗疏与齐梦麟都尽己所能帮她们讨回公道。随着桩桩悬案的破解，罗疏与齐梦麟的感情也逐渐升温，殊不知一场更大阴谋正在悄然逼近。
DNA Doe项目与警方合作，通过基因检测技术在美国各地识别5万具无名尸体，助力破获悬案，为逝者家属带来心灵慰藉。
