就读于东京都内私立高中的高一学生护郎，既没有「希望」、「梦想」，也没有「野心」，世界对他来说是「冷漠」的东西，一边对同班同学穗香抱有淡淡的憧憬，一边和好友秋津过着毫无变化的无聊的日常生活。有一天，护郎的智能手机收到了奇怪的通知。你被选中了。请注入你的愿望。护郎被选为“伟大的意志”，为了实现愿望，他将登上“神明”的宝座，与其他神明候选人们互相残杀，直到成为最后一人。
万世轮回，世世灭门，万世至亲！无一生还！这一世，记忆苏醒，我，谭云，曾经的鸿蒙至尊，定要让欺辱我至亲的人，付出血的代价，整个世界都会在我的脚下颤抖！
小智（松本莉香 配音）来自真新镇，他的目标是要成为神奇宝贝顶级训练师。在即将展开训练师旅程的一天，因为迟到，他并没有拿到初始的小精灵。大木博士（石冢运昇 配音）见状，便送了一只不愿进精灵球和非常调皮的皮卡丘给这位失落的年轻人。于是，他们俩便踏上了精灵宝可梦的旅程。
