本剧集故事承接第一部剧情，讲述汉武帝刘彻（黄晓明饰）经过五年执政后进入他实施雄才大略阶段的故事。已坐稳皇帝宝座的刘彻，此时却触景生情，感慨当年亲如手足的兄弟们多已不在人世，唯一仍在人世的李勇（杜淳饰）却陷落匈奴手中，东方朔也一去不复返。历经千难万险寻找李勇下落的秋蝉（刘芸饰），终于在匈奴找到他时却发现他已与匈奴公主成婚。汉武帝微服出游，邂逅长相酷似已逝的陈阿娇的歌伎李娃（何佳怡饰），不禁怜爱有加。不久李娃入宫成为刘彻的新宠。然而已为皇后的卫子夫（宁静饰）却预见陈阿娇的前车之鉴又要重演。汉武帝派汲黯（杨洪武饰）去寻访东方朔，无意间遇见了怀才不遇的狂士主父偃（王刚饰），认为是奇才，遂力荐主父偃入宫辅佐汉武帝。汉武帝听信谗言，将卫青（董勇饰）的兵权交给霍去病（李立饰）。

公元前202年，16岁的辛追是一个美丽而多情的湘女，她在即将嫁入江夏王府的当天，却遭遇了韩信大军的围城。江夏王宁死不屈，最终全家切腹自尽。辛追对生命的珍视使她在韩信百万围军的包围下，毅然选择打开城门，走到韩信面前，质问他为何要在她出嫁那天让她死于非命。韩信面对辛追的质问，无言以对，被她的勇气和美丽深深震撼。然而，尽管辛追的勇气令人动容，城池最终还是陷落，辛追成为了俘虏。韩信对这个美丽且倔强的少女产生了深深的感情，将她带回家中。辛追在韩信家中发现了一个令人震惊的秘密：婢女花样红杀死了韩夫人，并谎称她怀上的孩子是韩信的，但实际上孩子是钟离昧的，韩信已失去了生育能力。韩信的仁义之举—救下了公子丹，令辛追深受感动。公子丹在事败后被处死，他将辛追托付给韩信，自己则前往刺杀刘邦。辛追渐渐对韩信倾心，两人开始了热恋。然而，这段感情被皇帝刘邦发现了。刘邦被辛追的美貌迷倒，决心不惜一切代价夺取她的心。同时，楚国败将钟离昧也看中了辛追，试图利用她来实现复国的宏愿。辛追无意间卷入了复杂的阴谋之中，面对着一连串精心策划且令人心惊胆战的局面，她的命运也因此变得扑朔迷离。

张东官（徐峥 饰）有两个本事，一是变幻莫测鬼斧神工的切菜手艺，一是巧言善辩能尝出人间百味的灵巧舌头。张东官凭借着这两样本事在厨艺界里闯荡，然而却因为并不是真的会做菜而四处碰壁。之后，张东官结识了名为陆美美（张庭 饰）的女子，燃起了想和她一起经营全天下最大酒楼的梦想。机缘巧合之下，张东官结识了当今皇帝康熙（张铁林 饰），并在误打误撞之中被封了“江南第一名厨”的头衔，进入御膳房就职。根本不会做菜的张东官在御膳房中惹出了不少的麻烦和笑话。之后，张东官遭到奸人陷害出宫踏上了逃亡的旅途，途中开始潜心学习厨艺，并最终创立了满汉全席，被列入史册。

九皇子景灏（郭晋安饰）天资聪敏，智慧过人，是众望所归的皇位继承人，也是皇上（寇振海饰）心中唯一的皇位继承人。一次偶然的机会，偷偷溜出皇宫的景灏在民间遇见了御史中丞柳苍山之女柳文香（曾宝仪饰）。琴棋书画样样精通的才女柳文香令景灏一见倾心，立誓非她不娶。传位大典已安排妥当，可就在此时景灏却被人暗算，成了傻子。怎料阴差阳错，皇上竟误会他喜欢礼部尚书之女王妃（万妮恩饰），无奈之下景灏只得迎娶刁钻任性的王妃，从此家无宁日。对柳文香念念不忘的景灏，在贴身丫鬟爱儿（何苗饰）指腹为婚的未婚夫李文虎（赵亮饰）的哄骗下，离开京城，与侍卫李浩（刘晓虎饰）开始了寻找柳文香之路。30集古装喜剧电视剧《傻王闯天下》，由郭晋安、曾宝仪、刘晓虎等领衔主演。

秦朝末年，苛捐杂税重如山，民不聊生。富家千金吕雉（张可颐 饰）虽为女儿身，却胸怀大志，女扮男装外出寻找有志之士。她发现了时任泗水亭长刘邦（郑少秋 饰）宅心仁厚，对他渐渐生出好感。项羽（江华 饰）密谋起义，为了招揽黥面贼英布，单枪匹马闯入秦军军中将英布的仇人将领赵常斩杀，终于将英布收到帐下。刘邦发现了项羽的秘密。项羽本来想杀他灭口，但刘邦却对他表现得十分敬畏，哭诉了暴秦令人民生活凄苦，因此愿为他效力推翻暴君。于是项羽被感动了，决定招揽他，两人更以兄弟相称。随后，吕雉主动嫁给了刘邦，她知道自己将会辅助刘邦成就大业。秦始皇病逝，赵高扶立秦二世，秦二世荒淫无度，更引得天下大乱，群雄并起。项羽时势造英雄，终于揭竿起义了！

战国乱世，天下初定。德川幕府建立，拉开了最后一个武家王朝两百多年的序幕。时有乱臣之女阿福（松下由树 饰），因手刃猖狂的小妾而被丈夫休出家门。阿福满怀羞辱和悲愤，抛弃三个年幼的孩子来至江户。适逢二代将军秀忠的正室阿江与夫人（高岛礼子 饰）临产，阿福应征成为乳母。世子竹千代不久诞生，阿江与虽心怀不舍，却只能看着刚出世的孩子被交予乳母养育，从此在心中埋下仇恨的种子。此后的岁月里，阿福所抚育的竹千代以及阿江与养育的次子国松展开连番争夺继承人的斗争。

《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世， 为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。