故事发生在1996年12月31日，平日里冷酷无情的王帮办（王敏德 饰）在一次危险的任务之中误杀了一名人质，一时间，执法者沦为犯罪者，昔日里吃过他苦头的下属们纷纷伺机报复。长腰（林晓峰 饰）是初出茅庐的菜鸟警员，于执勤之中打死了一名小混混，起初，长腰深信自己系为民除害，沾沾自喜，然而，当他见到了小混混的亲人之后，后悔的心绪在他的内心蔓延。

张文静与苏文辉拍拖多年，但常因辉不肯放弃其警务工作，更令静日夜担心静决心搬往郊外居住。在静搬家途中，巧遇女探员乌小凤追击珠宝劫匪，劫匪之一阿表躲入了静的搬运车中，到了静的新居，静认识了嗜钱如命的士多老板达叔及其儿子太叔公，太叔公在帮忙清洁时发现了一钻石，不料从此引来诸多麻烦，众匪亦追踪而至，巧遇凤和辉，众人展开连场激战，将一干匪徒绳至于法。

　这是一个发钱寒的时代。硬汉探（许冠英 饰）梦想一夜暴富，混进了当地的亿万富翁陈千亿家中当保镖，伺机发一笔横财。这天，他得悉陈千亿的贴身保镖鸭咀（吴耀汉 饰）将托运三颗巨钻，于是尾随鸭咀至僻静路段时，提出平分三颗巨钻。岂料这时半路杀出个程咬金，少女玛丽（赵雅芝 饰）和她的 表哥突然出现，威胁二人交出钻石。四人争夺下，钻石竟意外被飞驰的汽车压碎了！他们这时才知道这些原来都是赝品。玛丽和盘拖出了心中的秘密，这些钻石原来为其契爷所有，被陈千亿设计骗了过来。硬汉探和鸭咀同情玛丽，决定帮其抢回钻石。 

丈（余文乐 饰）是香港深水区的一名放蛇警察，作为底层的警察，丈整日与一个难得见光的世界打交道，这里充斥着暴力、毒品，是社会阴暗的一个角落。要想在这里生存，丈不仅要学会如何做警察，更需要学习黑道的生存法则，渐渐地丈的身份越来越模糊，他生活在黑与白之间的灰色地带。Lulu（冼色丽 饰）是这一区的妓女，丈与之保持着来往，却始终没有将关系向前推进。一次意外，丈误杀小头目四眼堂（廖启智 饰），神秘杀手（樊少皇 饰）是唯一目击者，为了自保，丈和神秘杀手展开了一场追逐……杀手背后有怎样的秘密？丈是否能够逃过此劫？《青苔》为我们展现了社会阴暗处的小人物们如何似青苔一般生存。

经过多年努力，黄浩文（黄柏文）终于升任重案组督察一职，并拥有一个幸福美满的家庭。在一次围剿匪徒马骝行动中，文遇上了为求破案不顾后果的Michael（周文健），对其办案手法极之不满，连飞虎队队长李Sir（李修贤）亦直斥其非，谁料二人竟被安排成为拍档。透过马骝的口供，他们得知大圈帮头目汉（吴毅将）正策划一次大行动，并备有重型军火。果然，汉与两名匪徒不畏警方的严密监视，毅然照原定计划进行械劫行动，并与警方展开激烈枪战，激战中，文不幸被汉轰中头部身亡；匪帮逃至一间戏院，并挟持一小孩作人质，李Sir率领飞虎队员运用飞虎队战术，与匪帮展开一场火并的围捕行动。

阿保（雷宇扬 饰）、阿东（陈小春 饰）、螳螂（郑浩南 饰）、勇仔四人是社团内的刀手，专事清除社团的敌对人物。四人入行多年，在社团内地位颇高的同时也要面对无休止的杀伐跟其他社团的敌视。阿东行事稳重，投资各类事业，为几位兄弟的未来多有筹划；阿保做事极端，为螳螂出头得罪了尖沙咀大哥蛇皮，阿保发现女友艾薇（蒙嘉慧 饰）与阿东的暧昧视频，兄弟感情出现了嫌隙。阿东等人谋划除掉蛇皮，却被老大公子（曾江 饰）向警方出卖，侥幸逃脱的阿东、阿保放弃偷渡，返港为死去的手足报仇。

刑警李国强（余文乐 饰）击毙了杀人魔王陈福来，自己也身中数枪生命垂尾。他在医院休养了四十九天，但刚刚出院就告知职位已被调至杂物科，只因为他的证词里有一些科学无法解释的灵异现象。来到杂物科的李国强遇见了黄警督（郑伊健 饰），这个微胖又酗酒的中年人告诉他，和别的部门不同，杂物科专门处理那些所谓的“灵异事件”，但若想在这里生存下去，就必须坚定一个信念，那就是第一诫：“这个世上没有鬼！”可是这个世上却真的是有鬼的，连月来发生的数起诡异的自杀案件引起了李国强的注意。通过调查，他发现这是陈福来的魂魄杀心不改，他可以通过触碰附在任何人的身上，然后操纵他们的身体为所欲为。为了制伏凶手，李SIR和黄SIR强强联手，展开了一场惊心动魄的大追击。然而就在此时，李国强却渐渐的分不清楚，一直都在鼎力帮助自己的黄警督，他到底是敌是友。

1996年，香港警方预备在回归前夕涤荡黑帮势力，营造法制环境，戴先生掌控的社团首当其冲在打击范围之内。是夜，戴先生社团五大堂主之一的占米被人暗杀，身中两枪生死未卜，占米之妻张桦（蔡少芬 饰）远在台湾，授意保镖伍宝（余文乐 饰）代理老大一职调剂各方关系，阻止老二黑水（杜汶泽 饰）向其他四位堂主寻仇，咖啡（黄贯中 饰）、木星、沙纸三位堂主闻风而动，在乱局中各有盘算。真实身份是警方卧底的伍宝当夜宿醉难耐，又要在短短几小时内周旋于社团、黑水与警方之间，暗恋伍宝的亚玲（江若琳 饰）跟随相助，但社团混战随时可能爆发。另一方面，掌握了真凶的警方暗中布置，趁机派出内应把事件复杂化以便将社团一网打尽……

某雨夜，深圳一名妓女斯琴爱儿被女通缉犯叶小雁（吴倩莲 饰）狠狠的勒死了，小雁为的是得到斯琴爱儿的身份。小雁乔装成爱儿的样子，顺利通过了海关到达了香港，报失了身份证后，小雁成功取得了爱儿的身份。爱儿本身有个香港老公才得到了香港居民的身份，此时爱儿的老公也在苦苦等候妻子抵步。

警察乐一言（古天乐 饰）的独生女遭杀害，凶手施害手法极其残忍……这一切都指向亡命之徒宋境南（林家栋 饰）。怒火中烧的乐一言决定拼死一搏，为女复仇。两位父亲，三起命案，以爱为名的杀女之仇，这一次他一定要手刃真凶。

　　民国初年，硬猴拳宗师文彪（刘家良 饰）担任二当家的震远镖局名震江湖。一次保镖途中，文彪借马给过路侦探洪云虎（刘家辉 饰）时发现亲弟文豹夹带鸦片，文彪欲将文豹送官问罪，反遭文豹联合总镖头于海洋将其重伤后扔入河中，文彪拼尽最后体力爬上民女小敏的木筏…… 一年后。陈府公子陈嘉业醉心绘制猴拳图谱，尽管陈公子对武学一窍不通，但在“叔公”陈秋德（吴京 饰）帮助下得到了充分的绘画条件。两人在镇上搜寻猴拳传人，巧遇猴拳已颇有造诣的小敏，陈秋德跟踪小敏，偷窥学得一招半式。洪云虎拜访震远镖局致谢，发现这里已物是人非。陈秋德炫耀猴拳被洪云虎发现，大喜过望的洪云虎赶回震远报信，殊不知自己正把麻烦引向隐居的文彪……

黑社会老大文哥（高雄 饰）被人追杀，其弟阿南（任达华 饰）安排五个人来做其兄的保镖，并命令他们查出暗杀文哥的幕后人物。这五人分别是阿鬼（黄秋生 饰）、阿来（吴镇宇 饰）、阿Mike（张耀扬 饰）、阿信（吕颂贤 饰）和阿肥（林雪 饰）。阿来和阿信是知名的高手，阿鬼、阿Mike、阿肥则是金盆洗手的昔日英雄：阿鬼是文哥以前的手下，阿Mike是神枪手，阿肥是枪械专家。五人同心协力，将杀手擒获，并查清了幕后主使人。五个不认识的江湖人成为肝胆相照的好友，这时，阿南告诉阿鬼，阿信与文哥之妻通奸，要求阿鬼去杀死阿信，阿来坚决不允许这么做。阿Mike和阿肥又分别支持阿来和阿鬼，最后他们约定在一家小餐厅解决这个问题，互相对准的枪口真是一触即发……