《男子高中生的日常》以真田北男校为舞台，围绕着主角忠邦（入野自由 配音），以及他的死党秀则（杉田智和 配音）和吉竹（铃村健一 配音）的日常高中生活而展开。忠邦主要担任吐槽的角色，长相中性的他常常被秀则和吉竹联合欺负。登场人物还有同校学生会的元治、唐泽、副会长和会长等人，这是一群基本上没有女朋友的男校学生，在鲜有女生参与的情况下，展开了插科打诨的日常高中生活。
不会有什么有趣的事情发生吗？虽然智子心里发牢骚，但她自己并没有真正做任何事情，而是和小优以及突然闯入的黑帮（至少她是这么认为的）一起度过了慵懒的中学生活。有一天，智子用她找到的钥匙潜入了禁区屋顶。当我享受着一种奇怪的自由感时，一个我不认识的低年级学生偷偷溜到了屋顶上。智子非常慌乱，行为开始变得奇怪。
地球灵气复苏，强者崛起，少年林天却因爱人背叛惨死，连挚友也受牵连含恨而亡。临死前，他觉醒神秘灵气系统，意外重生到灵气复苏前夕。怀揣前世的痛苦与仇恨，林天誓要改写命运，守护挚爱，踏碎仇敌！踏上巅峰！
桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。
两千年前，阴阳家后人有感于秦始皇焚书坑儒，叹息于阿房宫付之一炬，为“不教天下才情付之东流”，他开始在文人墨客辞世之时，将其元神凝炼成笔，以保其才情流传后世。两千年后，普通大学生罗中夏意外获得李白的青莲遗笔，从此拥有了笔灵带来的超能力。但好景不长，多方势力都对青莲遗笔的强大力量趋之若鹜，也令罗中夏屡涉险境。为躲避纷争，罗中夏一心寻求退笔之法却接连受挫，反倒开始了一段与“管城七侯”的不解之缘．...
