岩仓玲音的同学四方田千砂自杀了。没有任何前兆的自杀事件让同学们不知所措，一周后，玲音收到了千砂的短信。明明已死的千砂居然以手机短信和玲音开始了交流。回到家，玲音用爸爸给她的电脑开始与千砂联系。当谈及为何自杀时，千砂回答说“因为我已经不需要身体了，没有身体，我可以在wired网络之间继续活着。”不解的玲音继续调查千砂的事件，发现wired网络之中隐藏的巨大秘密，玲音自己的身世也出现了谜团。玲音面对网络世界中的真相，耳边不断响起千砂的话“我生存在wired中，因为神在那里。
九岁的地球孩子「满满」，一天晚上在自己的衣柜里发现了来自多萌星系的外星小红人「萌奇」，得知宇宙飞船损毁严重，需要很长时间进行修复，充满正义感以及好奇心的满满于是决定将萌奇留在家中。为了表示感谢，萌奇决定用自己发明的「魔法心愿机」来帮助满满实现各种愿望，但是......由于魔法心愿机的不稳定性和满满自身的小缺点，实现的愿望往往事与愿违，笑料不断。
所谓的渡劫飞升，只是仙界的阴谋，仙界之下的小世界都只是为了给仙界之人培养奴仆，姚不挽不甘认命，开始找寻改变飞升之人命运的办法
在宝岛的激战结束后，千空等人平安回到了科学王国。他们用得到的石化装置，成功复活了陷入冷冻睡眠的司，司成为了科学王国的同伴！ 而在确定将人类石化的幕后黑手“怀曼”就在月球的千空等人，准备奔向月球！在这个石纪元，提出了从零制造宇宙飞船的宏伟工程。为了从全世界收集飞船的材料，千空等人迅速乘上珀耳修斯号驶向大海。要制造复活液，他们需要大量的玉米，于是第一个目的地就被设为了美洲大陆。而在结束了考验勇气、团结以及科学力量的大航海后，等待着的，是能动摇他们的威胁—— 千空等人的冒险，终于开始迈向世界，甚至迈向太空。为了拯救人类的未来，千空和同伴们一起，全力开拓科学的道路！
