沐浴后能致死的剧毒之雨“Blue Cyst”所导致的大灾难“新月之泪”。在那之后经过100多年的时间，人类终于开始走上了克服这一灾难的道路。在荒废世界的村落“Nest”中坚强生活的人们身边，发现了搭载类双对思考型AI的类人“梅加斯”的身影。
德光森太郎是个平凡的高中男生，因父母工作关系目前一个人住。一天他的住处阳台上竟躺了个可爱女孩飞羽，她自称是天使，奉神明之命来到人界学习人类相关之事！
约四十年前，人类在火星发现史前文明“Aldnoah”科技。伴随着火星殖民进程与科技垄断主张，火星开拓民与地球之间的摩擦越发扩大。
