渡劫期大修士陈凡陨落在天劫中，却一梦五百年重回地球的年少时代。回到地球时代的陈凡，决定踏踏实实重新学习，扎实根基，同时弥补之前的遗憾，帮助前世忘年交治好顽疾，并帮助同学渡过难关成功考学，最后找回自己的伙伴一起成长的故事。
亡国砚国的狐族公主姜瑾，魂穿乱世，险些沦为异族玩物，她奋起反杀逃出囚笼。逃亡路上，姜瑾收拢残将、解救流离百姓，组建瑾阳军。一路剿匪破敌，吸纳匠人、难民，积蓄人力物资。她挥师攻占孤城戈凤，修筑瓮城防御，开荒屯田，把残破小城打造成乱世庇护所。
万年前，魔君为护所爱，孤身持上古四剑踏上天路，硬撼天道，崩碎本源，留下万古裂痕，自身陨落轮回。万年后，江辞携魔君转世之身重临世间，与月神洛清河再续宿命前缘，尘封万年的上古四剑相继破封出世。天道秩序欲抹除一切变数，傀儡分身布下天罗地网。他以弑神戟为锋，以四剑为阵，以一身傲骨逆天而行。何为天命？何为定数？若九天皆为牢笼，我便一剑破之！若天道执掌宿命，我便亲手逆之！
历经层层艰险与重重考验，索菲亚与伙伴们在一次次并肩作战中，与各自相伴的独角兽结下了无比深厚的羁绊。他们彼此信任、心意相通，成功解锁了独角兽潜藏的强大魔法力量，凭借着勇气与默契携手守护着独角兽岛的和平与安宁，让这片神奇的土地始终充满光明与生机。当象征着祥瑞与魔力的精灵之月缓缓降临，命运精灵的力量也随之达到巅峰，整个独角兽岛都被温柔而神圣的光晕笼罩。此时，独角兽骑士们接到了全新的使命：他们需要与各自的独角兽伙伴一同出发，前往秘境深处，采集只在精灵之月期间悄然绽放的星耀之花，用以装点即将到来的盛大舞会，为庆典增添梦幻光彩。就在众人满怀期待、紧锣密鼓地为任务做准备时，伊莎贝尔却心事重重。她敏锐地察觉到，自己与独角兽蓝河之间的联结似乎悄然出现了隔阂，往日的默契与亲近仿佛蒙上了一层薄纱，这让她既困惑又不安。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中
