西歷2017年東京上空突然出現謎之侵入者,其目的一切不明,之後人類與稱之為MU的敵人的超兵器戰鬥,世界各國的軍隊均遭到嚴重的打擊,然而在TOKYO JUPITER形成後地球連軍與敵方形成膠著狀態,直到2027年現在MU的潛在危險仍存在著,地球也持續對抗....... 。
故事地点设立在平行宇宙的现代社会。在这个大环境背景下，所有人的手机上突然出现了一款末日游戏，而在末日游戏出现的十分钟后，游戏入侵现实，末日降临。 《末日游戏》是一款极度氪金的游戏，只要氪金，就能从各方面提升游戏中的角色数值。 一开始，并没有人把这款游戏放在心上，所有人都只来得及创建角色，但只有身为重生者的主角赵铭知道，这款游戏将会在一段时间后入侵现实——也即是游戏中的一切都会逐渐映照在现实中，包括玩家创建游戏角色的各项数值！ 换而言之，只要在游戏入侵现实之前将钱充进游戏，那么在游戏入侵之后，这些钱就会成为赵鸣最大的依仗！ 因此，赵铭开始大氪特氪，最终在游戏入侵现实之前将自己整整一个亿的现金氪进游戏中，并且获得氪金奖励，获得唯一一次职业【炼金术师】。 依靠炼金术师的能力和游戏开始前氪的一个亿，赵铭在这个危险的末日之中直接无敌，最终弥补了前世的遗憾，并且终结了末日。
末世来临，恐怖笼罩整个世界，地球成为丧尸和变异生物的狩猎场。赵天磊（男主）意外获得神秘的超级系统，虽然他不是圣人，但是看到眼前人间的惨状，以及同学们一个个死去，又怎能做到袖手旁观，且看拥有超级升级和兑换系统的赵天磊，如何带领人类与群尸对抗，恢复人类文明。
今天，日高佐菜（立花慎之介 配音）回到了曾经居住过的小镇上，他即将在那个充满了欢乐回忆的地方开始新的生活。可是，今日的日高早已不同于往日，曾经饱受欺辱的日子彻底改变了他单纯的性格，更有一道永远无法抹去的伤疤要陪伴日高度过他的余生。
