故事发生在一座民风淳朴风景秀美的小镇之中，曾经，天空上出现的巨大黑色圆盘令人们陷入了恐慌之中，但除此之外大家的生活却并未受到实质性的影响，世界依旧在照常运转着，久而久之，人们渐渐习惯了被圆盘笼罩的生活。
这是导演佐藤达夫的突破之作，他后来凭借《火星继承者：抚子》一举成名。这部动画讲述了三个少男少女组成的“少年侦探社”侦破神秘案件的故事，充满了戏仿的元素。五年级的小学生花冈勇和她的同学月影俊、雪见聪在一间仓库的地下室里发现了她们祖先——新选组的记录。三名少女意识到她们的使命是对抗邪恶的黑天狗一族，于是她们带着“新选组”（一群正义的盟友）给予她们的三件物品，出发去惩罚黑天狗一族以及在小镇上肆虐的各种恶棍。
皇太子在一次民间出巡，邂逅了一位民间女子。这位女子为皇太子诞下一名女儿。适逢盗贼作乱，皇太子与母女俩失散。数年后，皇太子已登基成为皇上，并寻回失散的女儿──甜丝丝。丝丝在民间流落多年，沾染了民间的市井习气，加上生性懒散，皇上为之头疼。皇上为了让丝丝成为一个高贵的格格，于是把她送进尚书房学习。甜丝丝格 格那顽皮、爱捣蛋的可爱性格为皇宫带来了新冲击，故事亦由此而起。此后，甜丝丝认识了尚书房班长心柔柔、从西洋归来的华伦，以及后备武状元白米饭。这四位好友与讨厌小朋友的大臣王坤，在皇宫发生连串趣事。
超级飞侠启程前往遥远的行星寻找可以修复超级空间站的特殊矿石“星核”。但在修复的过程中，星核遭遇撞击碎裂，碎片散落在世界各地。由于星核隐藏着巨大的能量，地球的动物收到星核的影响变得异常。乐迪、小爱以及伙伴们为了寻回星核碎片和消除星核造成的影响，将连同史前救援队和新的动物飞侠一起，去解决星核及金小子带来的种种困难。
