以虹猫蓝兔为首的七侠打败了魔教之后,森林大地眼看着恢复了和平，实际上却不得不面临一场更大的灾难。一颗陨星降落在蓝兔宫殿附近，蓝兔因此受到严重辐射而生命垂危，只有天狼门的金晶石才能救治。与此同时，鼠族的大祭司与鼠后则制定了一个阴险的计划:夺取传说中的全部五颗晶石，吸收陨星的能量称霸森林……
超级飞侠启程前往遥远的行星寻找可以修复超级空间站的特殊矿石“星核”。但在修复的过程中，星核遭遇撞击碎裂，碎片散落在世界各地。由于星核隐藏着巨大的能量，地球的动物收到星核的影响变得异常。乐迪、小爱以及伙伴们为了寻回星核碎片和消除星核造成的影响，将连同史前救援队和新的动物飞侠一起，去解决星核及金小子带来的种种困难。
