在世界各地,憨豆先生这部片受到了广大人的喜爱,借此继而又推出这一睰《憨豆先生动画系列》。憨豆先生是个智商号称“007”他有一点笨拙、有一点幼稚、有一点单向思维(脑筋不转弯)，有一点腼腆，最重要的是，他还是个思维有一点短路的家伙，他的喜剧感乃来自你我都有可能会发生的日常生活中。剧中对白极少，几乎都是靠他“丰富的肢体动作”和“变化多端的表情”来呈现。这部片的主人翁是按电视主角罗恩艾金森的形象构图而成，故事的内容构思巧妙、创意搞笑。
里见孝太郎（中村悠一 配音）是一位看似再普通不过的高中生，居住在房租极为廉价的可乐娜庄公寓106号房间，过着平静的生活。令孝太郎再也没有想到的是，在某一天，他波澜不惊的生活会因为一位少女的出现而彻底遭到改变。少女名叫东本愿早苗（铃木惠理 配音），她的真实身份竟然是寄宿在106号房间的幽灵，在企图吓跑孝太郎的计划失败后，早苗开始渐渐习惯起了和孝太郎“同居”的生活。想和孝太郎争夺房间的可不止早苗一个，身材火爆的古文明末裔仓野奇莉华（田泽茉纯 配音）、不期而至的魔法少女虹野由莉佳（大森日雅 配音）、从外太空远道而来的皇女提亚蜜思林（长绳麻理亚 配音），这些接二连三出现的美少女们，每一个人都将106号房间作为了侵略的目标。为了保护自己赖以生存的廉价租房，孝太郎的“战争”开始了。
讲述少年少女驾驶「有人驾驶的无人机」于「不存在的第86区」奋战，少年「辛」，与透过特殊通信指挥作战的指挥管制官少女「蕾娜」壮烈而悲伤的战斗与离别的故事。
