出身基層、道德意識薄弱的譚美貞（田蕊妮飾），為了袒護犯了法的男友（楊明飾），令自己身陷囹圄。幸得律師高哲行（郭晉安飾）在她出獄後，讓她在律師樓工作而重獲新生，並與他漸生情愫。高哲行原本是前途無限的明日之星，但被新紮幹探張立勳（吳卓羲飾）在某次追捕中所傷而成坐輪椅的殘障人士，同時成為二人犯法交易的契機。隨著高哲行連串不可告人的陰謀被揭發，張立勳感情用事，因內疚贖罪去包庇他。譚美貞最後能否背負愛情，做出正確的抉擇呢？
公元2000年，距离女娲回归只有一年的人世间。况国华孙子香港警察况天佑（尹天照饰）邂逅驱魔龙族马氏第四十代传人马小玲（万绮雯饰），两人互生情愫。苦恋况天佑的小玲好友王珍珍（杨恭如饰）被电视台监制司徒奋仁（陈启泰饰）追求，陷于感情困局中。奋仁因有超能力而被误为救世主，其实是由日东集团前主席山本一夫的DNA复制。此时香港出现僵尸杀人事件，幕后黑手日东集团主席堂本静（吴廷烨饰）遇上早已从沉睡中醒来的将臣（任达华饰），终如愿变成僵尸。一场今生前世的爱恨情仇正在上演。
继续上一季的结局，Jericho和New bern之间的争斗被号称第10山地师的美军强行镇压，同时Robert Hawkins继续在自家保存着唯一的核爆证据，试图联合Jake澄清这一系列事情的真相。
Fox宣布续订《紧急呼救：孤星》第二季。截至目前，《紧急呼救》第三季为Fox台本季度观看人数最多的剧集，《紧急呼救：孤星》为Fox台本季度18岁-49岁人群观看人数最多的剧集。
