缝在大脑上的线，俗称“记忆缝线”。1992年爆发了病毒性脑炎疫情，全靠这项医疗技术才得以平息，而到现在，它已经进化为了日常生活不可或缺的侵入式大脑信息终端。所见，所闻，乃至感情——在这个一切都会被记录下来的世界里，对重大犯罪案件进行调查时，需要特殊警探“电索官”来潜入记录的集合体“机忆”之中。天才少女埃缇卡·稗田，保持着成为电索官时的最年轻记录。但她也因为这样的天赋而走到孤立。正在此时，新的搭档，金发碧眼的人型机器人“人类之友”哈罗德，出现在她面前… 在最强的二人面前，一切秘密都将无所遁形！
故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦..
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小蓝（雨婷儿 饰）的生日快到了，魔仙女王决定送给她一个非常珍贵的音乐盒。魔仙女王告诉小蓝，这个音乐盒里有一枚拥有强大魔力的宝石，这颗宝石能够在关键时刻帮助小蓝、美琪（赵今麦 饰）和美雪（刘黛希 饰）化险为夷。
一位老友归来，零水垢想帮他重新找回自己在世界上的位置。但怎么做才是正确的呢？
