在中、苗、公子开明、暗盟合力之下，杀魔之局，棋差一着，元邪皇再度现世，六绝禁地接连被破，九界灾劫逼在眉梢，俏如来众人该如何阻止千年之魔的脚步，挽救人世？沉于暗处的势力，蠢蠢欲动，他们究竟是正？是邪？而在海境，鳞王昏迷不醒，掀起了皇权变动，这将会带领鳞族走向何种未来，于此同时，远在东瀛，剑无极、西剑流、面对复仇的残忍联盟，亦将各自恩怨情仇中，开启新的篇章…
舞台是在某个国家的某个地区莫斯特城市。在陈旧大楼的二楼有一家发行《月刊妄想科学》的小出版社。《月刊妄想科学》是一本异想天开，报道“真是吓人一跳！”的事件、即使是科学家也会发出“要不行啦！”声音的超科学现象的科学杂志。工作人员只有帅哥主编兼编辑的塔罗·J·铃木。再加上小学生助手吉罗·田中和狗狗三郎。编辑部一直是空的，塔罗、吉罗和三郎都沉浸在同一栋大楼1F的咖啡馆《岩石（ROCK）》中。有一天，科学家戈洛·佐藤前来咨询，由此开始了一个异想天开的故事……。
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城市中出现了来历不明的光病毒。 SRC中的Eyes队成员为要确认光源搜寻至镝矢岛，遇上了对怪兽充满爱心的预备飞行员春野武藏。此时，光病毒入侵怪兽力特里亚斯体内，力失控，Eyes准备向力发动攻击，武藏决要阻止，危急中，超人高斯终于回来。
