《狐妖小红娘》的故事围绕人与妖之间的爱情展开。根据古典小说记载，世上有人有妖，妖会与人相恋，妖寿命千万年，人的寿命有限，人死了，妖活着。人会投胎转世，但投胎以后，不记得上辈子的爱。妖如果痴情的话，就去找狐妖“购买”一项服务，让投胎转世的人，回忆起前世的爱。狐妖红娘这一个 角色就这样诞生，作品主要讲述了以红娘为职业的狐妖在为前世恋人牵红线过程当中发生的一系列有趣、神秘的故事。
全集主角是一位憧憬山吹高中美术科，并以优异的成绩入学的少女由乃。因为家中离学校很远，而住在学校校门前的公寓“向阳庄”。住在隔壁的是同学年的同学宫子而在各自房间正下方的是学姐寻和沙英。因为同住在向阳庄而变得熟悉的不同性格的四人，每天都有着既奇怪又有趣的事情发生。
天才兼疯子科学家Rick在失踪多年后突然回到女儿Beth的身边，并且在她的车库里搞了一个科学实验室。Rick有一把“传送门枪”，可以穿越到宇宙的各个次元。外孙Morty莫名其妙就成了他的助手，经常被拖进他的自制太空船内，跟他一同开展各种疯狂刺激的宇宙冒险。女儿女婿对他的 疯狂行为感到不满，却又对这个天才科学家无可奈何。
