小咖带领神奇的咖宝伙伴再次出发，一起守护时空。在这一季中，来自宇宙的外星人们带来全新的危机与挑战，它们偷走红色制造城市大乱、吸收海水严重影响生态、抢夺动物危害自然生命，还为了得到黄金而夺走人类的各种资源，甚至还与捣蛋兄妹结盟四处作乱，小咖和咖宝们每一次都果断出击，化解各种危机，他们又回到过去拯救远古生命、维护时空稳定，对付偷猎者、盗窃集团、诈骗分子和黑心商人，以及守护人们、动物们的安全和快乐，时刻保卫身边世界的和平与安宁。
三谷裳千绪（太空直美 配音）是就读于鲛岛学园的平凡高中一年级女生，无论是样貌、性格或是成绩，都只能用平平无奇来形容，然而千绪本人非常享受这种低调闲散的状态。在家里，千绪是个标准的游戏宅，总是沉迷于各种各样的欧美角色扮演游戏之中。千绪的家离学校并不远，所以每天千绪都依靠走路上学，奇怪的是，每一天，在千绪的上学路上，似乎有什么在冥冥之中阻挠着她抵达学校，状况百出，麻烦不断，而千绪兵来将挡水来土掩，最终总是能够化解危机。和千绪一起上学的，还有和千绪互相嫌弃的青梅竹马野野村真奈菜（小见川千明 配音）和田径部王牌细川雪（本渡枫 配音）等人。
该机构与国际刑警组织合作，拿下一个组织严密的珠宝盗窃团伙；阿彻对此表示怀疑，因为他们的国际刑警组织联系人似乎把这次任务看得更像是一次试演。
萧羽重生得知T病毒将席卷S市，丧尸还会持续进化，常规躲避方法失效。绝境中他意外激活系统，击杀丧尸可组建“职业女神战队”。萧羽救下安小冉，成功激活系统后战队成立，二人发现系统空间可共享，便开启疯狂囤货模式，从商场仓库到屠宰场一路扫荡。
《超级飞侠大百科》是动画片《超级飞侠》的衍生品。乐迪和他的一群好伙伴“超级飞侠”们环游世界，帮助小朋友递送包裹。而每天结束任务后，小朋友总有各种不一样的问题想问乐迪，在乐迪与他的好伙伴“超级飞侠”们的解答中，小朋友也学到了更多的科普小常识。神奇世界，一起发现，超级飞侠，勇闯天下。
