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前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
凌小多因为意外变成为了一本古言书中恶毒女配弦浅朵，为了改变原书女配的悲惨结局，凌小多表面假扮清冷千金大小姐，接管家族生意，在一次私下外出时意外救下被恶犬围攻的美少年，原本心性冷硬的他被凌小多的奇思妙想和可爱的性格所吸引，两人为了不被彼此发现真实身份引出了不少笑料，也携手渡过了多次危机，逐渐被彼此有趣的灵魂吸引。
神秘瑰丽的妖灵世界，奇奥无穷的时空妖灵之书，聂离追寻着世界真相。美丽温柔的叶紫芸、倔强高傲的肖凝儿，面对两位女神的青睐，他该如何抉择？还有患难与共的兄弟，一起修炼最强功法、最强妖灵之力，踏足武道巅峰。
在这一季里，超级飞侠们都升级成为了愿望守护者 。
