女娲使用光明之土造出了率真善良，豪爽正义的龙娃。又用光明之水造出了英姿飒爽，温柔可爱的凤娃，龙娃和凤娃视女娲为他们的母亲。天空中出现了巨大的黑洞，整个人界即将面临灭顶之灾，女娲煮化了五色石，试图填补漏洞，却将龙娃和凤娃也封印在了天上，从此母子被迫分离。伤心的女娲日日思念自己的孩子们，流出的眼泪汇聚在大地之上成为了黄河。
坂井悠二的高中生活刚刚开始，本将一直持续的平凡生活却因为一次偶然而发生了剧变。回家途中，商店街的时空突然停止，这封闭空间中所有人的灵魂都被魔物吸去。而手持日本刀与魔物战斗的灼眼红发美少女，告诉了悠二惊人的真相“你已经死了，现在的你只不过是以另一种形态活着。”接受了这个事实的悠二决定与这位灼眼红发美少女一起为世界而战，并以少女的武器名来称呼她为“夏娜”。为了世界的未来，夏娜被卷入了一次又一次的战斗之中，二人的羁绊就此展开。
