蓝星上资源匮乏，各国战争不断，楚风穿越到蓝星后绑定系统，却必须要等到百岁时才能激活。他蹉跎一生，终于在百岁时激活系统，每日签到获得超凡神力。与此同时，神秘的国运战场突然开启，楚风被选中成为代表龙国的参
魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
