仙魔大战二十之后，三界达到了微妙平衡的状态。而正此时，身负重要秘密的少年叶不归脱离了剑灵仙岛的保护，出现在众人眼前。 他的出现打破了平衡，随着战争结束沉寂了二十年的阴谋重新浮现，少年在试图保护世界的同时，也知道了自己的身世。他的人生征途充满危险，有人来也有人走。不归二字，或许就是他的宿命。
未来2479年，一个叫智囊的团体缔造了一系列庞大的虚拟程序世界集合，慢慢分化出各种想对其加以利用利益团体，一时超拟世界变得充满灰暗和勾心斗角，某天，在这些利益体之外，出现了两个单纯乐于在其中冒险的年轻人摩希和小K，他们展开的冒险之旅每次都带来新奇独特的体验，这样的体验给他们孤单而迷茫的灵魂带去了慰藉，让他们的生活不再停滞中现实的单调与冷漠之中，在历险的过程中，他们也在一步步认识自...
为了对抗突然出现的人类之敌「涅洛伊」，世界各国组成了联合军。但能够与他们对抗的，仅有具备特殊魔力的少女们而已……。由联合军主导的柏林夺还作战终于启动，再次成军的第501统合战斗航空团「强袭魔女」，在新的501成员「服部静夏」加入后，与涅洛伊的殊死战斗逐渐扩大化！究竟柏林的天空能否得到解放！？
