《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。
美丽纯洁的少女独孤梦一心出国，嫁给了一个海外华人，却被骗被卖，不幸落入国外黑社会控制中。以 蛇头身份奉命回国的独孤梦开了一家出国咨询公司组织 非法移民 偷渡出国。她找到了十几年前的恋人外事警官雷大克，想在他的帮助下从事非法活动。伴随着十几年来的恩恩怨怨，双方陷入情.....
现代女学生意外穿书为古代小说的恶毒太子妃陆双双（杨滕 饰），深知剧情的她为保狗命，决定与厌恶自己的太子墨承乾和离，并移情别恋男二。可太子却坐不住了，连番攻略只为求得美人心。太子追，太子妃躲，两人结局究竟如何上演......
黎璃（孙怡 饰）和裴尚轩（张若昀 饰）相识于十三岁那年，黎璃一下子就喜欢上了这个看上去有点酷酷的男孩，亦看透了他冷酷表面之下隐藏的一颗柔软的内心，可是，对于裴尚轩来说，黎璃不过只是一个普通的优等生罢了，他们完全生活在两个不同的世界。
