在浩瀚无垠的宇宙中，有一颗小小的行星，名叫祖维亚，那里生活着很多不同颜色的小毛球。勇敢、爱冒险的“嘉维”和他的七个小伙伴们，一起成立了“小毛球宇宙探索队”，驾驶着炫酷的飞船，在宇宙中开启了一场场奇妙的探索之旅。以太阳系探索为主线，从太阳到八大行星，每集围绕一个核心知识点，用趣味十足的小故事，揭开宇宙的神秘面纱。在探索过程中，小毛球们将面临各种新奇的问题，但他们积极思考、团结协作，运用自己的独特能力和智慧去解决问题，最终得出科学结论，并在过程中收获成长与友谊。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动……迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是———所有的答案，都在「Link Vrains」中
