青年顾野与天才黑客鹿晨遭鼎盛集团杀害，意外重生为黑猫与白鼠，发现对方正进行非法意识转移实验并夺取二人躯壳。为抢回身体、揭露阴谋，一猫一鼠组建动物情报网，闯地下斗狗场收猛兽，破克隆仓库，直捣空间站核心。途中揭穿慈祥老院长的幕后黑手身份，在克隆迷宫、高压毒气、十倍重力与意识深渊中死斗，最终夺回原装肉身，携林婉儿重返海港市。
五十年前，龙城穿越，铁血孤军，高举地球文明的战旗，面对异界万族的恐怖狂潮。五十年后，孟超重生，发现自己做贡献就能变强大。于是重来一世的男主拳打怪兽，脚踩恶魔，手撕古神，镇压异界，这一世，他发誓，一定要改写自己、改写父母，甚至是全人类的结局！
大雪覆门，妖修突袭，屠尽墨门，少年路朝歌痛失至亲，绝境之中觉醒绑定逆天系统，靠水系启灵死里逃生，立誓肃清世间妖邪。十年蛰伏苦修，他困于初境寸步难行，一朝契机重启系统，携妹妹路冬梨下山寻灵草破境。途中巧破异兽难题，逆天引九道天道敕令启灵，连破五重境界，还直面剑宗天骄邀战，昔日废柴掌门，自此强势逆袭。
2015年，配以电脑为导航系统的赛车比赛-Cyber Formula，取代了F1（一级方程式）成为21世纪世界最高水平的赛车赛事。14岁的少年风见隼人在护送父亲生前设计的赛车“阿斯拉”（ASURADA）到日本富士冈赛车场途中受到不知名的攻击，危急之下被迫驾驶“阿斯拉”，却因此被系统记录为唯一赛车手，不得不与职业赛车手新条直辉、布里德•加贺、卡尔•里婿特•冯•兰德尔等人一起角逐新世纪的赛车冠军。一站站的赛车比赛，不仅有赛车手之间的竞争，更有与青梅竹马菅生明日香之间的羁绊，风见隼人从此展开了新世纪GPX史上最年轻的冠军传说。
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
