前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
《萌鸡小队第五季》全新加入了小萌鸡、美佳妈妈和动物朋友之间由音乐产生的美妙故事。萌鸡小队载歌载舞地解决成长中遇到的困难，在过程中小萌鸡们慢慢长大，一路探索有趣且想象力的世界。
故事发生在一个人族、魔族和神族和平共处的世界之中。土见禀（杉田智和 配音）是一个非常平凡的男孩，自幼失去了父母的他和青梅竹马的好友枫（后藤邑子 配音）生活在同一屋檐下，虽然禀只将枫当成是妹妹一样疼爱，课时枫对于禀的感情早已经超越的了友情。
