影片故事围绕三年级的小学生马小跳展开。马小跳可是个不寻常的孩子，他一生下来就会跳！在他的抓周仪式上，脾气火爆的马小跳更是一“跳”冲天，令所有人大吃一惊。三年级的马小跳身边总是围绕着伶牙俐齿的“猿猴”毛超、贪吃爱睡的“企鹅”唐飞和力大无穷的“河马”张达这几个死党，当然还有无条件超级崇拜马小跳的安琪儿。
三年前，男主沈煜晨和女主莫染各自被陷害而一夜缠绵，却并不记得对方容貌。男主被拍照...
前作中以三号机驾驶员巴武藏的牺牲为代价，终于打败了恐龙帝国，但又出现了由有角人类构成的百鬼帝国也要征服世界。补充了新驾驶员車弁慶及新机器盖塔G的早乙女研究所又投入了战斗。
