影片故事围绕三年级的小学生马小跳展开。马小跳可是个不寻常的孩子，他一生下来就会跳！在他的抓周仪式上，脾气火爆的马小跳更是一“跳”冲天，令所有人大吃一惊。三年级的马小跳身边总是围绕着伶牙俐齿的“猿猴”毛超、贪吃爱睡的“企鹅”唐飞和力大无穷的“河马”张达这几个死党，当然还有无条件超级崇拜马小跳的安琪儿。
本剧讲述超级飞侠继续从全新的超级空间站出发，升级为电能超级飞侠，前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并用升级电力技能帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在哈尔滨冰雪节，他们用高超的电能技能阻止了金小子、金小薇造成的冰雕骚乱；在澳大利亚的伍伦贡，他们通过时空旅行穿梭到恐龙时代，和翼手龙宝宝一起练习飞行；尽管困难不断，但电能超级飞侠会用炫酷的新技能、新装备，继续圆满地解决问题。
吉迪恩（铃木崚汰 配音）因为跟不上大部队战斗的节奏，而遭到了贤者阿雷斯（八代拓 配音）的驱逐，阿雷斯和队友们谎称吉迪恩是自己离开的。离开之后，吉迪恩以雷德之名开了一家药店，自己兼顾采药和卖药，这样安稳的生活对于他来说，似乎也是一种不错的选择。一天，雷德的老相识莉特（高尾奏音 配音）突然拜访了雷德的药店，原来，她从种种渠道得知，雷德正是当年失踪的吉迪恩。慢慢的，莉特留在了药店里，一边帮忙工作，一边展开了和雷德的同居生活。之后，雷德的妹妹露缇（大空直美 配音）、雷德曾经的战友亚兰德拉拉（雨宫天 配音）也纷纷出现在了雷德的身边。
天赋异禀的灵宠师樊凌霄，于甲级门派晋升赛上遭人暗算，被自己的灵鲲所吞噬。睁眼醒来却发现自己已化身为一名叫“流锋芒”的少年，身处白府大牢之中，其门派凌霄阁也走到了绝境。为查明灵鲲反噬真相与重振门派，樊凌霄带着现有的几只灵宠，与谷灵、程曦、月彤，一起踏上了全新的冒险之旅。
