故事叙述阿空、阿静、阿能、阿震、阿风和杨一击等六位个性迥异的年青人，在曾受过军事训练的唐少校、柯娜和福伯带领和帮助下，互相融合、互相接纳、彼此学习，逐渐成长为拥有强大的爱心、超凡的意志及守护正义的能力的有为青年，组成了团结勇敢、战无不胜的“巨神战击队”。 六个年青人运用各种高科技神奇力量去对抗想要破坏并占领地球的邪恶势力，他们不断地迎接一次又一次挑战，不断地在战斗中学习成长，在历经无数次艰难险阻之后，最终在大家团结齐心的不懈努力之下，战胜了邪恶力量，保护了地球的和平。
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萌宝战警因一个恐龙蛋的到来开启了全新任务。古生物的复活引来了黑暗势力的争夺，在保护小恐龙的过程中，意外发现了其它恐龙蛋以及恐龙DNA的秘密。经改造，萌宝战警分别拥有了自己的机甲恐龙，危机时，与他们并肩作战。而想要夺取恐龙DNA，从而统治宇宙的反派也蠢蠢欲动，一场DNA存储卡的争夺愈演愈烈......
