小学时期，游泳部的四名成员在毕业前的游泳比赛中夺冠，之后他们毕业的毕业，出国的出国，四人分道扬镳。时过境迁，就读岩鸢高中的七濑遥（岛崎信长 配音）和好朋友橘真琴（铃木达央 配音）升上高二，他们与昔日的游泳部成员之一叶月渚（代永翼 配音）重逢。三人回忆起小学时光，约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里，他们居然遇到了归国的松冈凛（宫野真守 配音）。意料之外的是，昔日战友凛性情大变，还对遥发起挑战，结果遥输给了他。
全新《三国杀》大奖挑战赛横空出世，因人陷害禁赛两年的天才选手郭小野再度挑战巅峰。为了证明自己找回初心，和自己的本命武将郭嘉过关斩将，却在比赛中发现了骇人阴谋——游戏中的伤害竟然能传递给现实中的玩家！
因为憧憬的前辈、摄影部部长牧之原的毕业，新任摄影部部长雨宫五月陷入了消沉。在朋友雾山杏的鼓励下，五月重新振作起来，购买了新的全景相机，却迟迟没有到货。发现卖家就在附近的五月和杏找到了学校附近的粗点心店，与漫画家秋山春乃相遇了。之后，摄影部与敷岛樱子的电影部合并，成为了“电影摄影研究部”（日语：シネフォト研究部），共同帮助春乃的漫画取材。
小咖与神奇的咖宝团队一直守护着大自然与城市安全，拯救各种危机。新一季中，他们将迎来更多挑战，捣蛋家族胡乱使用科技装备，制造如失重漂浮、狂风暴雪、沙尘危害、流星坠落等破坏事件。作为城市小卫士，小咖带领咖宝们勇敢出击，消除险况。
