神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
蛰伏七年的陈铭在召唤大典上智计无双，虽遭S级御兽背叛，却化逆境为转机。他果断破局，凭借充足准备成功复活母亲遗留的炽焰天使。面对重重挑战，他坚守初心，以不屈的意志踏上崛起之路，最终成为传奇御兽师，用实力与担当书写热血逆袭的励志篇章。
神秘瑰丽的妖灵世界，奇奥无穷的时空妖灵之书，聂离追寻着世界真相。美丽温柔的叶紫芸、倔强高傲的肖凝儿，面对两位女神的青睐，他该如何抉择？还有患难与共的兄弟，一起修炼最强功法、最强妖灵之力，踏足武道巅峰。
