神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
勇敢的咕咕嘎嘎与伙伴Dora开启惊险刺激的野外求生冒险！两人穿行于燥热无垠沙漠、幽深神秘地底等多样秘境，一路上遭遇形形色色的野生动物与奇异昆虫。他们凭借智慧与默契迎战对手，战胜生灵后收集肉类、蔬菜等生存物资。一轮又一轮全新冒险接踵而至。跌宕起伏的旅程兼具战斗趣味与野外生存知识，伙伴携手并肩成长，在险境之中不断突破自我。
将清纯可人的“租借”女友·水原千鹤介绍给家人和朋友，谎称她是“真”女友的废柴大学生·木之下和也。
在无法说出真相的情况下，和也继续维持着这段“虚假”的关系。在共同经历各种事件的过程中，他内心对千鹤的“真实”感情日益加深。
