魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
谢看花即将被上林天宫处决，在苏白衣一行人援救过程中，上林天宫解体，苏白衣被幽狱中自困二十年的魔君苏戬带走。轩唯城英雄大会再度召开，白极乐以“天地同悲”面具引诱天下第二高手薛神官前往，江湖大乱。苏白衣为救负伤的南宫夕儿，与苏戬去往北昆仑求见苏家老祖苏锁莫，谢羽灵、风左君则纷纷前往青城山和恶魔城学习武艺。暗流涌动中，瀛洲仙岛再现，瀛洲来客向武林人士发下挑衅，顺者昌、逆者亡......
那还是人与非人的世界未曾分开的远古故事。
