魔法——這不是傳說或童話的產物，而是發展至今將近一個世紀的現實技術。今年春天，持有施展魔法能力的「魔法師」培育機構「魔法科高中」，某位少女將入學就讀。容貌秀麗、完美無缺的優等生——她的名字叫「司波深雪」。深雪夢想著和一同入學的哥哥——達也過著親密的高中生活，但擋在她面前的是一科生與二科生——優等生與劣等生的高牆……!? 由愛慕哥哥之心更勝親情的妹妹——深雪的視角所鮮活描繪的，另一個「魔法科高中」在此上演。
昔日修仙界第一人“九魔帝尊”，遭遇背叛重伤失忆，自以为境界跌落，实则修成“返璞归真”境。直到大夏太子、宗门圣子、盗圣传人、天赋孤儿四个绝色美男跪在猪圈前求道，她才勉为其难收徒。她以为自己喂的是泔水，徒弟喝的是万年灵液；她以为自己养的是秃毛鸡，徒弟看到的是焚天凤凰。
