《宇宙护卫队》第一季故事围绕着正直勇敢的队长老虎“风暴”，天生的行动派猴子“闪电”，知识渊博头脑聪明的兔子“彩虹”三位宇宙护卫队队员展开。他们乐于助人、帮助不同的小动物们解决各类问题，三人相互协作，一同保护地球上的动物居民。每一集他们都会帮助一个小动物，并在执行任务的过程中学会接纳彼此的不同。而在帮助每个小动物的过程中，他们也会了解到这些动物身上的特征，比如海马是爸爸负责“生育”宝宝，猪的嗅觉居然比狗还灵敏等等。
阿久津瑛太是一位孤独、内向的机甲宅男。他甚至还暗恋过一个女孩。她是吾妻真希奈，一位极其美丽、开朗且受欢迎的女孩。一天晚上，马基纳出现在瑛太家门口。她的身体似乎有些奇怪，当她突然露出赤裸的身体时……那是一个机械身体，而不是人类身体！ Makina 是一款专为性爱而打造的人工智能机器人，但其访问成人信息受到限制。 Eita 是一名处女，但对女性有洁癖，而且极其善良。他们两个开始一起生活，不允许任何人透露他们的真实身份！
