自公元2001年，况天佑（尹天照饰）、马小玲（万绮雯饰）和他们的一班好友成功阻止女娲灭世危机后，世人度过了三年和平的日子。然而世上最后一个女神瑶池圣母（陈炜饰）为了重投人王伏羲（郑浩南饰)的怀抱，竟以红雪病毒将整个盘古灭族。天佑更是身受病毒之苦，小玲因而回到宋朝，寻找天佑前世。为了拯救生死未卜的天佑，小玲孤注一掷地踏上了征程。当天佑出现与小玲重逢时，命运却再次捉弄世人。圣母、人王二人因为命运与憎恨决定开战，马小玲、况天佑又再次肩负起救世的重任。
林雪娥（吴浣仪 饰）永远也不会忘记自己曾经犯下的罪孽，为了保护家人而将杀人的重罪嫁祸到了阿凤的头上，如今阿凤越狱逃跑不知踪迹，成为了林雪娥心中永远的痛。一晃眼数十年过去，林雪娥的儿子刘志光（刘青云 饰）成长为了铮铮铁骨，一次偶然中结识了名为叶芷玲（陈法蓉 饰）的女子，两人坠入了爱河。林奕龙（黎明 饰）是阿凤的儿子，与母亲失散多年的他误入歧途，被收入了惩教署，遇见了在那里任职的刘志光。得知了林奕龙的真实身份，刘志光的心中充满了愧疚，随着时间的推移，两人成为了好友，林奕龙更是爱上了刘志光的妹妹刘静宜（罗慧娟 饰）。
刘小怜（柴碧云 饰）与丁格尔（李倩 饰）是情同手足的好姐妹，两人一同面对生活中的困境。由于丁格尔因为意外错过大学面试，她和小怜一同选择了护校，并在毕业后被分到同一所医院工作。在医院，她们经历了人生的起起伏伏，而科主任郝湘宁的儿子吴南成为了小怜心仪的对象。然而，夏天退伍回来后，格尔对夏天展开了攻势，而夏天却一直想要与小怜重新修复旧好。在小怜和吴南领结婚证的那天，吴南前女友阿蒙因伤被送进急诊室，吴南冲上前帮助阿蒙，让小怜感到心酸和失望，最终伤心离去。夏天与小怜婚后事业有了大的发展，但面临怀不上孩子的困扰。在妇产科工作的格尔的帮助下，小怜顺利生下了夏家宝。然而，格尔得知夏天即将得到遗产后，编造了一个关于家宝身世的谎言，逼迫小怜与夏天离婚。夏天与小怜离婚后却因救人而受伤，昏迷不醒。丁格尔的罪行被揭露，她受到了法律的制裁。
路招摇（白鹿 饰）在出山后救下了墨青（许凯 饰），却在争夺万钧剑时被墨青抢先一步。万钧剑出世的巨大冲击让路招摇身受重伤，经过五年的隐忍和治疗，她才得以痊愈。当她重返自己的门派时，惊讶地发现墨青已经将门派建设得更加强大、富有声望。为了实现她的计划，路招摇选择隐瞒自己的身份，巧妙地利用了墨青对她的深厚感情，驱使他去完成一些危险的任务。虽然她一开始的目的是利用墨青来达到自己的目的，但在墨青的关怀和宠爱中，路招摇渐渐动摇了最初的决心。随着时间的推移，路招摇和墨青之间的关系变得越来越复杂，两人逐渐从最初的利益合作发展出深厚的感情。在共同经历了种种挑战和考验后，他们联合打败了宗门内伪善的洛明轩，将其真面目公之于世。这一过程中，路招摇和墨青不仅在战斗中找到了彼此，也在面对困境和敌人时加深了对对方的理解和信任。最终，在大战之后，两人携手共度余生，实现了共同的理想和幸福，摆脱了过去的阴影，迎来了属于他们的美好未来。
神秘岛的成功引发了扩张计划，岛屿团队与神秘山的同行们进行了一场友好的谋杀游戏，但这场乐趣却以一场显而易见的谋杀而告终。
